Khi phát hiện hóa đơn đã lập sai, hóa đơn điều chỉnh kê khai vào kỳ nào là câu hỏi phổ biến mà kế toán viên, chủ doanh nghiệp, và hộ kinh doanh thường gặp phải. Sai lệch này có thể dẫn đến hình phạt từ cơ quan thuế, làm phức tạp công tác kế toán, và gây khó khăn trong quản lý tài chính. Theo Thông tư 91/2026/TT-BTC vừa có hiệu lực từ 01/07/2026, quy định về kỳ kê khai hóa đơn điều chỉnh đã được rõ ràng và cần được tuân thủ đúng.
Tại Điều 10, Thông tư 91/2026/TT-BTC, Bộ Tài chính đã quy định chi tiết về xử lý hóa đơn điện tử đã lập sai. Cụ thể, hóa đơn điều chỉnh không kê khai vào kỳ phát sinh hóa đơn gốc, mà kê khai theo nguyên tắc sau:
Điều này có nghĩa là doanh nghiệp và hộ kinh doanh không thể kê khai bổ sung vào kỳ ban đầu khi phát hiện sai sót. Thay vào đó, chỉ kê khai vào kỳ có tính chất thực của giao dịch điều chỉnh.
Quy định trên giúp:

Hóa đơn điều chỉnh kê khai vào kỳ nào?
Hóa đơn điều chỉnh được lập trong các trường hợp người bán phát hiện lập sai một số nội dung, bao gồm:
Khi các thông tin trên hóa đơn không còn đúng với thực tế giao dịch (ví dụ: sai mã số thuế của bên mua, sai thành tiền, thuế suất không đúng quy định).
Khi hàng hóa ghi trên hóa đơn khác biệt so với thực tế cung cấp (quy cách sản phẩm, chất lượng không khớp).
Ngoài các trường hợp chỉ liên quan đến tên, địa chỉ hoặc các nội dung hành chính không ảnh hưởng đến giá trị và thuế suất.
Trường hợp sai về các yếu tố lớn (ký hiệu mẫu, ký hiệu, số hóa đơn), người bán chỉ được lập hóa đơn điều chỉnh duy nhất, không thể thay thế.
Để hóa đơn điều chỉnh được cơ quan thuế chấp nhận, bắt buộc phải ghi dòng chữ sau:
"Điều chỉnh cho hóa đơn Mẫu số [], ký hiệu [], số [], ngày [] tháng [] năm []"
Dòng chữ này giúp xác định rõ hóa đơn nào được điều chỉnh, tránh nhầm lẫn với giao dịch khác. Đây là yêu cầu bắt buộc — thiếu dòng chữ này, hóa đơn có thể bị cơ quan thuế từ chối, dẫn đến phạt, xử phạt hành chính, thậm chí ảnh hưởng đến lợi nhuận và uy tín doanh nghiệp.
Xem thêm: Chi phí lương được trừ khi tính thuế TNDN – Điều kiện và hồ sơ cần thiết năm 2026
Khi kê khai sơ tính GTGT hoặc sơ tính thuế TNDN, doanh nghiệp phải:
1. Xác Định Kỳ Kê Khai Hóa Đơn Điều Chỉnh
2. Ghi Chép Giá Trị Hóa Đơn Điều Chỉnh Đúng Dấu (+ hoặc −)
3. Lưu Giữ Chứng Cứ

Cách kê khai hóa đơn điều chỉnh trong kỳ kê khai thuế
Theo quy định, không có thời hạn cụ thể để lập hóa đơn điều chỉnh sau khi phát hiện sai. Tuy nhiên, nên lập sớm nhất có thể để tránh rủi ro kiểm tra từ cơ quan thuế, bởi thời gian càng lâu, rủi ro bị phạt càng cao.
Nếu phát hiện sai nhiều lần trên cùng một hóa đơn:
1. Nếu phát hiện sai hóa đơn cách đó 3 tháng, có được kê khai bổ sung vào kỳ gốc không? Không. Theo Thông tư 91/2026, phải kê khai vào kỳ phát sinh hóa đơn điều chỉnh (kỳ khi lập hóa đơn điều chỉnh), không kê khai bổ sung vào kỳ gốc.
2. Người mua nhận hóa đơn điều chỉnh muộn, có thể kê khai vào kỳ trước được không? Không. Người mua phải kê khai vào kỳ nhận được hóa đơn điều chỉnh. Nếu nhận muộn, thì kê khai vào kỳ đó.
3. Hóa đơn điều chỉnh có phải kèm theo bảng kê chi tiết không? Tùy vào loại giao dịch. Nếu hóa đơn gốc có bảng kê (ví dụ: hàng tặng), hóa đơn điều chỉnh cũng phải có bảng kê chi tiết.
4. Có bị phạt nếu sai kỳ kê khai hóa đơn điều chỉnh không? Có. Sai kỳ kê khai là vi phạm quy định về kê khai thuế, có thể bị phạt từ 2-5 triệu đồng hoặc cao hơn tùy trường hợp.
5. Hóa đơn điều chỉnh có cần được cơ quan thuế cấp mã không? Có. Hóa đơn điều chỉnh vẫn phải được cấp mã bởi cơ quan thuế thông qua hệ thống (nếu là hóa đơn điện tử) hoặc phải có ký hiệu mẫu khi lập (nếu là hóa đơn giấy).
6. Nếu điều chỉnh toàn bộ số tiền, có được ghi giá trị âm bằng toàn bộ hóa đơn gốc không? Có, nếu cần điều chỉnh giảm toàn bộ, ghi giá trị âm cho toàn bộ hóa đơn. Tuy nhiên, nên cân nhắc xem có nên dùng hóa đơn thay thế thay vào đó không.
Xem thêm: Xuất hóa đơn ăn uống theo quy định mới nhất từ 01/07/2026
Hóa đơn điều chỉnh kê khai vào kỳ nhận được (người mua) hoặc kỳ phát sinh (người bán), không kê khai vào kỳ hóa đơn gốc. Đây là quy định rõ ràng trong Thông tư 91/2026/TT-BTC và là yêu cầu pháp lý mà mọi doanh nghiệp, hộ kinh doanh tại Hải Phòng, Hà Nội, Hà Giang cần tuân thủ.
Việc tuân thủ đúng quy định không chỉ giúp doanh nghiệp tránh rủi ro phạt, mà còn đảm bảo sổ sách kế toán chính xác, cơ sở dữ liệu sạch sẽ, và hỗ trợ công tác kiểm soát nội bộ hiệu quả. Nếu còn bất kỳ thắc mắc nào về cách lập hóa đơn điều chỉnh, điều chỉnh kỳ kê khai, hoặc các vấn đề pháp lý liên quan đến hóa đơn, hãy liên hệ với chúng tôi ngay.
Công ty TNHH Dịch vụ Doanh nghiệp Ngọc Vân